Skimmer protein, kadangkala dirujuk sebagai pemecah buih, digunakan untuk mengeluarkan pepejal terlarut dan zarah halus yang tidak ditangkap oleh penapisan mekanikal. Dalam sistem, sebahagian daripada skimmer protein mengeluarkan pemendapan pepejal di bahagian bawah biofilter, dan bahagian lain mengaktifkan semula biofilm yang dilucutkan dalam biofilter dan menambah mikroorganisma berfaedah, kembali ke biofilter dan dengan itu membentuk peredaran dalaman. Proses skimming adalah paling berkesan dalam sistem air masin.