Les RAS sont utilisés dans les aquariums domestiques et pour la production de poissons où l'échange d'eau est limité et où l'utilisation de la biofiltration est nécessaire pour réduire la toxicité de l'ammoniac. D'autres types de filtration et de contrôle environnemental sont souvent également nécessaires pour maintenir une eau propre et fournir un habitat convenable pour les poissons. Le principal avantage du RAS est la capacité de réduire le besoin d'eau fraîche et propre tout en maintenant un environnement sain pour les poissons. Les RAS ont des densités d'empoissonnement élevées et peuvent être exploités de manière économique et commerciale.