تُستخدم كاشطات البروتين، والتي يشار إليها أحيانًا باسم مجزئات الرغوة، لإزالة المواد الصلبة الذائبة والجسيمات الدقيقة التي لا يلتقطها الترشيح الميكانيكي. في النظام، يقوم جزء من مقشدة البروتين بإزالة الترسبات الصلبة في الجزء السفلي من المرشح الحيوي، ويقوم جزء آخر بإعادة تنشيط الغشاء الحيوي المجرد في المرشح الحيوي ويضيف الكائنات الحية الدقيقة المفيدة، ويعود مرة أخرى إلى المرشح الحيوي وبالتالي يشكل دورة داخلية. تعتبر عملية القشط أكثر فعالية في أنظمة المياه المالحة.